內容包括元素循環中微生物之角色(microbial roles in element cycles)、環境污染物(environmental pollutants)、(微)生物生長與功能(microbial growth and functions)、工程化生物處理系統原理與應用(principle and application of engineered biological treatment systems)、生物處理系統功能指標評估(treatment performance of biological treatment processes)、及分子生物技術於微生物族群分析之應用(applications of molecular biotechnology in microbial community analyses)等。期能建立學生對環工生物技術之基礎概念及實場應用能力，並熟知環工生物技術在污染整治過程中扮演之角色。

本課程教授對象為環工系3-4 年級學生，內容包括元素循環中微生物之角色(microbial roles in element cycles)、環境污染物(environmental pollutants)、(微)生物生長與功能(microbial growth and functions)、工程化生物處理系統原理與應用(principle and application of engineered biological treatment systems)、生物處理系統功能指標評估(treatment performance of biological treatment processes)、及分子生物技術於微生物族群分析之應用(applications of molecular biotechnology in microbial community analyses)等。期能建立學生對環工生物技術之基礎概念及實場應用能力，並熟知環工生物技術在污染整治過程中扮演之角色。

Environmental Biotechnology: Principles and Applications. Bruce E. Rittmass and Perry L. McCarty. 2001. McGraw Hill Co.